下列行政区域变更的法律程序由全国人大审批的是：
A.省、自治区、直辖市的建置
B.省、自治区、直辖市的区域划分
C.自治州、县、自治县、市的隶属关系变更
D.涉及海岸线、海岛、湖泊、重要自然资源地区的隶属关系或界线变更
解析
第一步，本题考查国家机构知识。
第二步，根据《宪法》第六十二条第十三项，全国人民代表大会行使下列职权：(十三)批准省、自治区和直辖市的建置。
因此，选择A选项。
拓展
B项：根据《宪法》第八十九条第十五项，国务院行使下列职权：(十五)批准省、自治区、直辖市的区域划分，批准自治州、县、自治县、市的建置和区域划分。B项错误。
C项和D项：根据《行政区划管理条例》第七条，下列行政区划的变更由国务院审批：(一)省、自治区、直辖市的行政区域界线的变更，人民政府驻地的迁移，简称、排列顺序的变更;(二)自治州、县、自治县、市、市辖区的设立、撤销、更名和隶属关系的变更以及自治州、自治县、设区的市人民政府驻地的迁移;(三)自治州、自治县的行政区域界线的变更，县、市、市辖区的行政区域界线的重大变更;(四)凡涉及海岸线、海岛、边疆要地、湖泊、重要资源地区及特殊情况地区的隶属关系或者行政区域界线的变更。所以C项和D项错误。
考点
法律
宪法
国家机构
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