国务院同意环保局提交的《三峡库水面漂浮物清理方案》，并要求有关单位贯彻执行，行文时选用：

　　 A.批复

　　 B.通知

　　 C.通告

　　 D.命令

　　 解析

　　 第一步，本题考查公文文种知识。

　　 第二步，根据《党政机关公文处理工作条例》第八条……(十二)批复。适用于答复下级机关请示事项。国务院是环保局的上级单位，同意环保局提交的《三峡库水面漂浮物清理方案》，因此，行文应该用批复。

　　 因此，选择A选项。

　　 拓展

　　 B项：根据《党政机关公文处理工作条例》第八条……(八)通知。适用于发布、传达要求下级机关执行和有关单位周知或者执行的事项，批转、转发公文。不符合题意，B项不当选。

　　 C项：《党政机关公文处理工作条例》第八条……(六)通告。适用于在一定范围内公布应当遵守或者周知的事项。不符合题意，C项不当选。

　　 D项：《党政机关公文处理工作条例》第八条……(三)命令(令)。适用于公布行政法规和规章、宣布施行重大强制性措施、批准授予和晋升衔级、嘉奖有关单位和人员。不符合题意，D项不当选。

　　 考点

　　 公文

　　 公文的基本知识

　　 公文文种