1.主体不同，资金来源不同:

　　事业单位属于事业法人。资金来源主要是国家财政拨款。公司属于企法人，资金来源主要是筹资或是股东投资。

　　2.设立目的不同:

　　事业单位大都是由国家机关和地方政府设立的。不以盈利为目的，是为国家或社会服务，社会公共利益的需要。公司以盈利为目的。

　　3.管理主体不同:

　　事业单位主要是由政府主管部门负责的。事业单位往往有其隶属的政府主管部门。政府主管部门主要是依靠行政管理的法规、规章、条例、命令和政策对事业单位进行领导和管理。公司都是在法律法规允许的范围下，遵守企业(公司法)进行自我管理，对自己的行为负责。

　　4.分类不同:

　　公司的主要形式为无限责任公司、有限责任公司，两合公司、股份有限公司、股份两合公司，其区别于非盈利性的社会团体、事业机构等。