环境保护税会计分录如下：

计提环境保护税时：

借：税金及附加

贷：应交税费——应交环境保护税

交纳计提的环境保护税时：

借：应交税费——应交环境保护税

贷：银行存款

环境保护税应通过“税金及附加”、“应交税费——应交环境保护税”科目进行核算。根据《中华人民共和国环境保护税法》规定，在中华人民共和国领域和中华人民共和国管辖的其他海域，直接向环境排放应税污染物的企业事业单位和其他生产经营者为环境保护税的纳税人，应当依照本法规定缴纳环境保护税。

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